I think I should use the words that I'm most likely to use
I think I should use the words that I have a high possibility of using
主語が"I"なので"thinks"ではなく、"think"を使います。また、"which"よりは"that"を使った方が自然です。そして"words have ~"というよりは、英語では「自分が〜をする」と言うことが多いので"I have ~"の方をよく使われています。"high possibility"という表現を使うなら②のように、"words that I have a high possibility of using"になります。"words"は複数形なので"has"ではなく"have"になります。
または、①のように「可能性が高い」と似たような意味をもつ"more likely to ~"もよく使います。「よく使うだろう」という意味です。