Do you use the same type of coffee beans for A and B?
Do you make A and B with the same type of coffee beans?
アイスカフェラテはエスプレッソに牛乳を入れた飲み物ですが、アイスにするのに手間がかかるので、お値段が高く設定されているのだと思います。でも、ホットとアイスで豆の種類を変えるこだわりのお店かもしれませんね！
Do you use the same type of coffee beans for A and B?
「AとBは同じコーヒーを使ってますか。」
ご質問文と少しニュアンスが異なりますが、私ならこちらの言い方にすると思います。
Do you make A and B with the same type of coffee beans?
「AとBは同じコーヒーで作られていますか。」
A, Bには”ice latte” “espresso”など、比較している飲み物の名前を入れます。
日本 
