My stomach has something to tell me. My stomach is trying to tell me something.
一般的に一番使われる表現は、
My stomach is rumbling.
あるいは
My stomach is grumbling.
などです。
相手にグーという音を聞かれたときに、ちょっと面白い言い方をすれば、
I'm sorry, but my stomach is trying to tell me something.
と言えば笑えるかもしれませんね。