"This is the accommodation building, and that is the laboratory building."
"棟"を英語で説明する時は、その建物の使用目的や機能によって名称が異なります。ホテルの宿泊施設であれば "accommodation building" や "guest wing" などと呼びます。大学の実験施設であれば "laboratory building" や "research wing" と呼ばれることが一般的です。
決まった表現を使いたい場合、"This is the [building's purpose] building, and that is the [another building's purpose] building." という形を使うことができます。"building" の前にその建物が何のために使われているかを表す単語を置きます。