「ねぐら」は roost や nest と言います。
roost は名詞にも動詞にもなり、名詞だと「ねぐら・止まり木」という意味の他に、鶏の鶏舎という意味にも使われます。動詞だと「ねぐらにつく・止まり木に止まる」です。
nest も「（鳥の）巣・ねぐら」という意味がありますが、こちらは巣作りをする種類の鳥に使えるかなと思います。
Blue jays use a big branch in a pine tree in our backyard as their favourite roost.
「アオカケスは庭の松の木の大きな枝をお気に入りの止まり木として使っています。」
That bird looks like it's searching for a place to roost.
「あの鳥はねぐらを探しているようだ。」
I saw a mother and her two baby birds flying back to their nest.
「お母さん鳥と二羽の小鳥がねぐらに飛んで帰るのを見た。」
ご参考まで！
カナダ 
