What prefecture do you have the most students from?
Where are the vast majority of your students from?
日本語の通りに言うのは難しいですね。次のように言うのが一番近いかと思います。
ーWhat prefecture do you have the most students from?
「どの県の生徒が一番多いですか?」
prefecture で「県」
ーWhere are the vast majority of your students from?
「あなたの生徒の大多数は、どこ出身ですか?」
vast majority で「大多数」
ご参考まで!
以下のように言うことができます。
1. **Which prefecture are most of your students from?**
あなたの生徒は、どの県出身の人が一番多いですか?
2. **Where in Japan do most of your students come from?**
日本のどの地域からの生徒が一番多いですか?
Students from which prefecture take your lessons the most?
・Students from which prefecture take your lessons the most?
「どこの都道府県の生徒があなたのレッスンを一番多く受講していますか?」
・Which prefecture do most of your students come from?
「あなたの生徒の多くはどこの都道府県出身(在住)ですか?」
「Students from where 〜」もニュアンスはしっかり通じますが、「which prefecture」(どの県)を文頭や主語の部分に持ってくると、より自然で綺麗な疑問文になります。