ひとつだけわからないことがあるって英語でなんて言うの？

これはわからなかったところがあるという言い方であれば、I didn't understand one thing. でいいと思いますが、そのわからなかったところも一文に入れるのであれば、One thing I did not understand well is... として、isの後にわからなかったことを入れるといいと思います。

例）
One thing I didn't understand well is about the way to improve my listening skill.
リスニングスキルの伸ばし方についてが、いまいちわかりませんでした。

There is one thing I don't understand
「分からないことが一つあります」
の意味です。

タイトル文をそのまま訳してみました。

thingの後が関係代名詞のwhichが省略されていて、I don't understandがone thingを修飾しています。