綿棒のようなものですよね?それなら swabbing material とは言わず、swab だけで良いです。
「水を含ませる」なので let water contain と言いたいお気持ちはわかりますが、とても不自然な言い方になってしまいます。
1) dip a swab in the water
dip で「浸す」
「スワブを水に浸す」という意味になります。
2) put some water on a swab
「スワブに水をつける」
put some water on ... で「水を…につける」
ご参考になれば幸いです!