ーThe medicine is not really working.
「薬があまり効いていない。」
work には「薬が効き目がある」という意味があります。
ーThe medicine is not having much of an effect.
「薬はあまり効き目がない。」
effect で「薬の効き目」
例：
The doctor prescribed me some medicine, but it's not really working.
「医者が薬を処方してくれたが、あまり効いていない。」
prescribe で「薬を処方する」
ご参考まで！
カナダ 
