この場合、次のように言うと良いと思います。
ーthe experience of extracting a pearl from a shell
「貝殻から真珠を取り出す体験」
「真珠を取り出す」ことは
to extract a pearl from a shell
to take a pearl out of its shell
のように表現できます。
例:
There is a place where you can take a pearl out of its shell and make a piece of jewellery from it.
「貝殻から真珠を取り出し、(取り出した真珠で)ジュエリーを作れる場所があるよ」
ご参考まで!