上の階の席いいですか？って英語でなんて言うの？

この場合、次のようjに聞くと良いですよ。

ーCould we have a table upstairs?
「上の階に座ってもいいですか？」
to have a table で「テーブルに着く」

ーCould we be seated up there?
「上に座ってもいいですか？」
上の階を指差しながら、このように言うこともできます。

ご参考まで！