I think either you get used to your new shoes or your shoes get used to your feet.
ご質問ありがとうございます。
"I think either you get used to your new shoes"=「君が、新しい靴に慣れるか、」
"or your shoes get used to your feet."=「あるいは、君の靴が君の足に慣れるかだね。」
(又は、"or you get your shoes used to you."=「あるいは靴が君に慣れてもらうかだね。」とも言えます。)
ご参考までに。