Could it be that her colleagues, who didn’t think highly of her, intentionally made her the leader of a small army, knowing she would lose?
こんにちは!
ご質問ありがとうございます。
ご質問について、いくつか言い方が考えられますが、例えば、
Could it be that her colleagues, who didn’t think highly of her, intentionally made her the leader of a small army, knowing she would lose?
とすると、『彼女のことをあまり高く評価していなかった同僚が、負けることを知っていて意図的に彼女を小さい軍の隊長に任命した[わけじゃなくて](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/98825/)?』となります。
Could it be that を使って『ひょっとして~というわけじゃなくて?』というニュアンスを伝えています。