何科の医師をめざしてるの？って英語でなんて言うの？

「何の専門を目指している？」という質問を聞きたいなら、下記の英語を使えます。 What do you hope to specialize in? What will be your specialty? What kind of doctor do you hope to become? もし、医師以外の仕事について話しているなら、下記の英語を使えます。 What kind of medical professional are you going to be? What job will you do when you graduate? What field are you hoping to enter?

「目指す」は to aim for と言いますけど、医者などについて話している時、to specialize in を使われています。例えば, He specializes in internal medicine. または A doctor who specializes in internal medicine. まだ学生ですので、will(未来形) や want to do(~になりたい) を使った方がいいです。