英語ではおにぎりをライスボールと言いますって英語でなんて言うの？

ご質問の状況では主語はWeが適切であると思います。
尋ねている人はおにぎりの英語を知らず、逆に尋ねられている人は知っているという点で両者には明確な境界があります。
この境界をYouに対してWeで区別するのは自然なことです。

Youを主語にした例文というのは、疑問文のやり取りではなく、恐らく単に日本語話者が英語話者に向けて「英語ではおにぎりをrice ballって言うんでしょ」といった話をしている状況を想定しているものだと思います。

何を主語に置くかというのは状況によって変わるものですから、その時々に相応しいものを使われてください。

What do you call おにぎり in English?
「おにぎりを英語で何と言いますか？」

We call it（おにぎり） rice ball (in English).
「（英語では）rice ballと呼んでいます」

ご参考になれば幸いです。