to put X in Y と言うパータン(構成)です。X と Y は名詞です。
X は入れるものになり、
Y は入れられたものになります。
そして「マイバッグ」は Y になり、買ったものが X になります。
「マイバッグ」を my bag あるいは this bag (このバッグ)として指します。
Yとなる買ったものは代名詞にしたら使いやすいです。
it は「そのもの」 them は複数である「そのもの」
これ、それ・これら、それらは this, that, these, those という指示系である代名詞で、その中のどれでもシチュエーションに合わせて使えます。