上に行く手段によって、違う表現が使えます。もし、エレベーターなどの乗り物を使って上る場合、「Please go up two floors above.」とシンプルに伝えられるでしょう。
階段の場合、「climb」や「Walk」と脚を使う表現が使えますので、「Please climb/walk up two floors upstairs.」という表現が適しています。
また、「そのフロアはこの階から二つ上の階です」という言い回しであれば「That will be two floors above this floor.」という伝え方が自然です。