ご質問ありがとうございます。
「OOでは」はin OOになります。例えば、In Japan, we have a rainy season. （日本では梅雨の時期があります）です。
「流行っている」は辞書に探したらfashionableとかpopularなどが出てしまうかもしれませんが、それらを使うのは絶対ダメです。上の二つの回答英文を安心して使ってみてください。
ご参考いただければ幸いです。
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーIs the Coronavirus still spreading in Canada?
「まだカナダではコロナが流行っていますか？」
to spread を使ってコロナの流行を表現できます。
ーIs Covid-19 still prevalent in your country?
「まだあなたの国では、コロナが蔓延していますか？」
to prevalent で「蔓延する・流行る」とも言えます。
ご参考まで！
アメリカ合衆国 
カナダ 
