リンゴの色は何色ですかって英語でなんて言うの？

"What color is an apple?"と"What color are apples?"の両方とも使えると思います。

"What color are apples?"の場合ですが、リンゴの種類によって色が違うので、この質問だとその可能である色を全て答えなければいけない、と解釈される場合もあると思います。

"What color is an apple?"と言えば、ある一個のリンゴの色だけ答えれば良いので、"red"や"green"と一言の答えが返ってくると思います。

What colour is an apple は使えなくもないですが
この場合はリンゴを主張してるので the を使った方が
良いです。

リンゴが一つだと apple で複数だとapples と言います。

色 は color と colour があります。
前者はアメリカ英語のつづりで後者はイギリス英語のつづりです。