I don't know what to use as the subject (of the sentence).
I don't know which is the subject.
I dont know what to do for the subject.
ご質問ありがとうございます。
「主語」はsubjectと言います。subjectはトッピクとか話題の意味もありますので、もっと詳しくまで通じるためsubject of the sentenceと言えます。
何にすべきはwhat to useとかwhat to doになります。
「迷う」はlostと言いますが、英語でlostを使うと結構難しい文になりますので、don't know(知らない)を使いました。lostの例文はI'm lost as to what to do for the subject of the sentence.です。
ご参考いただければ幸いです。