進学するのか就職するのか最後に決めるのはあなた自身ですよ。って英語でなんて言うの？

You are the person who can～ ～できるのはあなたですよ という言い方がこの構文で表現できます。 最終決断をする、は make a final decision 会話では少し重いかもしれませんが日本語のニュアンスを残すと こうなるかなあと。 You can decide whether to ~ とかでもいい気はしますが。 進学か働くか whether to go to college or start working. 大学に進むか働き始めるか。という感じにしてみました。

up to youで、「あなた次第」と表現することもできます。 学業と仕事を掛け持ちすることも多いと思いますので、どちらかの選択であれば就職はget a full-time job、work full-timeなどとされるとよいかと思います。