あなたのお店ではどのメーカーの製品を使用していますか？って英語でなんて言うの？

いわゆるメーカーは、manufacturerです。
makerは「作り手」となり、もっと規模の小さい個人単位のニュアンスになります。
製造業者、メーカー、と言いたいときはmanufacturerを使ってください。

御社ではどのメーカー（の商品）を使っていますか、という場合、日本語では「御社」や「貴社」という言い方をしますが、英語では人称代名詞"you"で済みます。
逆に、弊社と言いたいときは、"we"です。
our companyとかyour companyと言わずとも、これでOKです。

英訳1：「メーカー」のことを尋ねるなら会社名を知りたいわけですが、分野によってはブランド名で尋ねることも多い（例えば、パソコンのメーカーを聞く場合、アップルですか？マイクロソフトですか？と聞くより、マックですか？ウインドウズですか？と聞くように）ので、brand を使っても自然です。

英訳2：go-to は「特定の」や「頼りにしている」また「主に使っている」といった形容詞です。go-to maker なら「（これと決めて長年使っている）メーカー」といったニュアンスです。go-to は、人に対しても使うことがあり、go-to guy「大黒柱な人」「頼りになる人」という表現もあります。

英訳3：establishment には「施設」という意味があるので、your establishment で、「あなたの会社の設備／備品」を暗示します。

その他の例文：
- What brand do you use for your business?