ご質問ありがとうございます。
"I use my commuting time"＝「私は通勤時間を使っています」
"for my walking exercise."＝「私のウォーキング運動のために。」
☆"commuting time"を単に"commute"と言っても構いません。
☆同じく、"walking exercise"を"walking"と省略することも可能です。
☆"use"の代わりに"allocate"（当てる）も使えますが、少しフォーマルなニュアンスになります。
ご参考に。
I walk to work for my health instead of taking the train.
おっしゃられている内容は以下のようにも表現できると思いました(*^_^*)
I walk to work for my health instead of taking the train.
「電車に乗る代わりに、健康のため徒歩で会社に行っています」
もし健康のためではないなら、for my healthは省けばよいと思います。
以上です。
少しでも参考になれば幸いです(*^_^*)
★★大阪カフェレッスン英会話講師 KOGACHI
ご質問について、いくつか言い方が考えられますが、例えば、
I use my commute time for walking.
『通勤時間をウォーキングにあてています』
また少し変えて
I walk to work to get exercise since I don't have much time.
や
I make the most of my commute by walking.
というようにも表現できます。
役に立ちそうな単語とフレーズ
commute 通勤、通学
exercise 運動、練習
make the most of 最大限に活用する、有効利用する
アメリカ合衆国 
日本 
