I don't know how he would be in the future. という言い方は不自然ですね。
詳しいシチュエーションがわかりませんが、次のように言うことができると思います。
ーI don't know what he will be like in the future.
「将来彼がどうなっているか私は分からない」
ーI don't know how he will turn out when he's older.
「彼は将来どのように育つか私は分からない」
to turn out「〜になる・〜に育つ」を使っても表現できます。
ご参考まで!