この場合、次のような言い方ができます。
ーI saw a little boy holding a bag in his mouth.
「男の子がバッグを口に咥えているのを見た」
to hold a bag in one's mouth「バッグを口に咥える」
ーA little boy was carrying a bag between his teeth.
「男の子がバッグを口に咥えて運んでいた」
to carry a bag between one's teeth で「バッグを口に咥えて運ぶ」と言えます。
ご参考まで!