I wonder if the package I sent is being handled properly during transport.
こんにちは!
ご質問ありがとうございます。
ご質問について、いくつか言い方が考えられますが、例えば、
I wonder if the package I sent is being handled properly during transport.
とすると、『私が送った荷物はちゃんと輸送されているかな?』と言えます。
その後に
I hope it will be delivered without any issues.
『問題なく配達されるといいけど。』というように言ってもよいかもしれないですね!
参考になれば幸いです。