I would like to express my gratitude in making an exception to my change in reservation.
ご質問ありがとうございます。
「この度は、例外的に[予約変更](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/33410/)の対応をしていただき感謝いたします」と言いたいなら、英語で「I would like to express my gratitude in making an exception to my change in reservation.」と言えます。
ご参考になれば幸いです。
Thank you very kindly for making an exception in allowing me to change my reservation.
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーThank you very kindly for making an exception in allowing me to change my reservation.
「例外的に予約変更を許可していただき心から感謝します」
to make an exception 「例外を認める・許可する」
ご参考まで！
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