社内システムで手続きしてくださいって英語でなんて言うの？

こんにちは！
ご質問ありがとうございます。

ご質問について、いくつか言い方が考えられますが、例えば、

Please complete the procedure through the internal system.
『社内システムで手続きしてください』

Please use the internal system to complete the procedures.
とすると、『社内システムを使って手続きを完了して下さい。』と言えます。

役に立ちそうな単語とフレーズ
complete various procedures さまざまな手順を完了する

参考になれば幸いです。