きっと原因はあるって英語でなんて言うの？

この場合、次のような言い方ができますよ。

ーThere's definitely a reason why he is not doing well.
「彼が調子が良くないのには絶対理由があるよ」

ーHe must be sick for a reason.
「彼は理由があって病気なのに違いない」＝「彼が病気なのには理由があるよ」

ご参考まで！

ご質問ありがとうございます。

・「There must be a reason.」
「There must be a reason behind it.」

（意味) きっと原因はあるはずだ

<例文>There must be a reason behind it but I don't know the reason.

<訳>きっと原因はあるはずだ。でも原因がわからない。

参考になれば幸いです。