I have to take some pills to kill Helicobacter pylori.（ヘリコバクター・ピロリ菌を除菌するために、薬を飲まなければなりません）
「取り除く（＝除菌する）」はeradicateやremoveなど難しい動詞もありますが、口語ではkillで表現することも可能です。
Receive treatment to remove Helicobacter pylori (H.pylori).
ピロリ菌 - Helicobacter pylori (H.pylori)
除去する - to remove
治療を受ける - receive treatment
例文：
抗生物質, 制酸剤, やヒスタミンH2受容体拮抗薬を飲んでピロリ菌を除去する治療を受けてる。
I am receiving treatment to remove H. pylori by drinking antibiotics, antacids, or histamine H2 receptor block.
日本 
