When you go upstream, resistence is created so the speed of the boat becomes slower.
When a boat goes upstream, the water resistence slows the boat down.
When you go upstream = 川を上がる時に
Upstream = 川上 (逆にdownstream = 川下)
Resistence is created = 抵抗が生まれる
Water resistence = 水の抵抗
The speed of the boat becomes slower = 船の速さが遅くなる
Slows the boat down = 船を遅くさせる
1)は一般的な例という感じなので、主語は"you"となる。"あなた"という意味ではなく、"人が" "例えばあなたがという意味です。
2)の場合はその船が主語となります。