This year we'll hold the small event that we have every two years.
その大きいイベントと比べているなら、「small」を「smaller」に変更します。
(We also have a large annual event, but) our smaller biennial event will be held this year.
「2年に1度」は「biennial」と言います。ネイティブでも混乱しますが、「毎年に２度」という意味だと、「biannual」でも「semi-annual」でも使えます。
This year is the year they have a small event, but next year will be a bigger event.
They only have a small event like this every other year.
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーThis year is the year they have a small event, but next year will be a bigger event.
「今年は小さいイベントを行う年だが、来年は大きいイベントを行う」
ーThey only have a small event like this every other year.
「このような小さいイベントは2年に一度だけ行われる」
ご参考まで！
アメリカ合衆国 
カナダ 
