「短く区切って音読してくれませんか」って英語でなんて言うの？

例文２は直訳です。英語では悪くはないですが、例文１はもうちょっと自然な英語でしょう。

「pause after each phrase」は「句と句の間に一時停止して」「毎句の後、ポーズして」という意味です。

例文３は会話で使わらず、テストの説明みたいな文章です。

コンマごとに区切って声に出して（はっきりと）読んでください。
という意味になります。

read out loud…声に出して読む、はっきり読む
taking a breath…途中で区切って、

どうでしょうか。