Unfortunately, that is something that we won't be able to do.
ご質問ありがとうございます。
丁寧に断りを入れたい時に「〜することは[できません](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/56716/)」と言いたいなら、英語で「Unfortunately, that is something that we won't be able to do.」という風に言えます。
「申し訳ありませんが予約することはできません」の場合、「Unfortunately, making a reservation is something that we won't be able to do.」になります。
ご参考になれば幸いです。