①「腹痛はありますか?」は次のように言えます。
ーDo you have any pain in your stomach?
「腹部に痛みがありますか?」
pain「痛み」
stomach「お腹・腹部」
ーDoes your abdomen hurt?
「腹部が痛みますか?」
abdomen「腹部」
hurt「痛む」
②「腹痛はないですか?」と言うなら
So you don't have any pain in your stomach.
「では、お腹に痛みはないですね。」
のように言うのが良いと思います。
ご参考まで!