ご質問ありがとうございます。
「頼んだものと数が違う」は英語で「The number was different than what I ordered.」になると思います。
「物が届いて、合計の数はあってましたが、各品物の数が違っていました」だと「The things I ordered arrived and the total amount was correct, but the number for the individual items was wrong.」になると思います。
役に立てば幸いです。