I took the first one when I arrived at the airport and then I took the second one at the hotel when my quarantine period was over.
こんにちは!
ご質問ありがとうございます。
『空港に着いた時とホテル隔離期間が終了した時、それぞれPCR検査をして、両方とも陰性でした』は、
The result of each PCR test that I took was negative. I took the first one when I arrived at the airport and then I took the second one at the hotel when my quarantine period was over.
として
『各PCR検査の結果は陰性でした。第一回目は私が空港に到着したときに受け、第二回目は隔離期間が終了した時にホテルで受けました。』と表現しました。
検査を2回受けていらっしゃるとのことですので、『一回目と二回目』the first one and second one としてそれぞれの場合の状況をwhenを用いて説明しました。
参考になれば幸いです。