It's unfortunate, but I will be absent from the day after tomorrow's lesson.
It's unfortunate, but I can't attend the lesson the day after tomorrow.
ご質問ありがとうございます。
明々後日はthe day after tomorrowかthe day after nextと言います。でも、the day after nextはそんなよく使われていないと思いますので、the day after tomorrowを提案しました。
「とても残念ですが」としてはit's unfortunate, but以外、it's regrettable, butとかI'm sorry to say thatと言えます。
ご参考いただければ幸いです。
アメリカ合衆国 
