You should put on your rain boots as it is raining today.
「履こうよ」と呼びかけている感じでしたら、最初の例文(Let's~)を使います。
【履いたらいいよ(履きなさい)』という感じでしたら、2番めの例文がお薦めです。
履く put on
長靴 rain boots (rain shoesではありません)
雨が降っているから as it is rainy あるいは as it is raining
(as は、「~ので」because (なぜなら)等より、軽く、ちょっと理由をつけたす時の言い方です)
ご参考まで。