ご質問ありがとうございます。
表現方法はたくさんありますので、その中でも２つご紹介しますね。
まず、「なるほど」という相槌は I see. や Alright. を使うことができます。
また、"Not A, it's actually B." ということによって
「Aではなく、（実際は）Bだということですね」
と表現できます。
このときに、"You mean not A, it's actually B." と You mean を文頭につけると、「あなたが言っているのは…ということですね」と確認の意味を強めることができます。
さらに、"A is not right and B is correct." で
「Aは正しくない、そしてBが正解ですね」
と言うことができます。
ご参考になれば幸いです。
**I see, so it’s not ○○, it’s △△.**
**Got it, it’s △△, not ○○.**
英語ではこのような「訂正の確認」や「理解の再確認」を、**I see**, **Got it**, **So what you mean is...**, **Oh, I thought it was ○○, but it’s △△** などを使って表現します。
もっとカジュアルに言いたい場合は **Got it** を使い、丁寧に言いたい場合は **I see** や **So what you mean is...** が適しています。
So you mean it's YY, not XX.
『つまり、〇〇ではなく△△ということですね。』
Oh, I get it now! So it's YY, right?
『あ、理解できました！じゃあ△△ということですね？』
相手から指摘を受けた時に「なるほど」と納得したことを伝えるには I see（なるほど、分かりました）や I get it（理解できました）を使います。
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