There are two sets of phonetic symbols that have the same sound in Japanese.
この場合、次のように言うと良いと思います。
ーThere are two sets of phonetic symbols that have the same sound in Japanese.
「日本語には同じ音を持つ2組の表音文字があります」
two sets of ... で「二組の…」
phonetic symbols で「表音文字」
to have the same sound で「同じ音を持つ」
ご参考まで！
Japanese has two sets of phonetic characters that share the same pronunciation.
Japanese has two sets of phonetic characters that share the same pronunciation. 『日本語には、同じ発音を共有する2種類の表音文字体系があります。』
two sets of phonetic characters は、ひらがなとカタカナという「2つの文字の組（体系）」を指す専門的な言い方です。
phonetic characters は「表音文字」を意味します。
share the same pronunciation は、「同じ発音を共有している」という意味です。
カナダ 
アメリカ合衆国 
