I was woken up against my will, so I'm in a foul mood.
ご質問ありがとうございます。
① "I was forced to wake up,"=「私は無理やり起こされました」
"so I'm in a bad mood."=「なので私は機嫌が悪いです。」
② "I was woken up against my will,"=「私は嫌だというのに起こされました」
"so I'm in a foul mood."=「なので私は不愉快です。」
②の方が①よりもやや深刻なニュアンスがあります。
ご参考に。