出席扱いになるって英語でなんて言うの？

ご質問ありがとうございます。

"At my school,"＝「僕の学校では」

"the card-reader scans my school ID"＝「カードリーダーが僕の学生証を読み取る」

"and then I'm registered as being present."＝「そして、僕は出席として登録されます。」

☆「通す」がもしクレジットカードのように動作でしたら、swipeという動詞が使えます："I swipe my student ID for my attendance."＝「出席のために学生証を通します。」

ご参考までに。