I'm having trouble understanding you. Could you please speak a little slower?
I can't quite follow you. Could you try to speak more slowly?
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーI'm having trouble understanding you. Could you please speak a little slower?
「あなたの言っていることを理解するのに困っています。もう少しゆっくり話してもらえますか?」
to have trouble ~ing で「〜するのに困る」
ーI can't quite follow you. Could you try to speak more slowly?
「おっしゃることがよくわかりません。もうちょっとゆっくり話してもらえますか?」
to follow someone で「はっきり理解する」
ご参考まで!