"I'm sorry I couldn't put the clothes back properly."
"I'm sorry for making a mess."
"I'm sorry for ~" 「〜すいません」
"making a mess" 「ぐちゃぐちゃにしてしまい」
"I'm sorry I couldn't put the clothes back properly."
"I couldn't ~" 「〜できなかった」
"put the clothes back" 「服をなおす」
"properly" 「ちゃんと」
[ぐちゃぐちゃ](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/4288/)についてもっと詳しく知りたい方はクリックしてください。
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーSorry I messed up that shirt.
「シャツをぐちゃぐちゃにしてすみません」
to mess up ... を使って言えます。
ーSorry, I didn't fold it up properly.
「ちゃんと畳まなくてすみません」
to fold ... up で「…を畳む」
もしTシャツなどならit で良いですが、ズボンなど複数扱いのものなら them になります。
ご参考まで!