The flight won't be until later in the night, so...
ご質問ありがとうございます。
このシチュエーションでホテルフロントに質問したいなら、「帰国[便](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/14726/)が深夜なので最終日の夜8時位まで滞在するなら料金は一泊の金額かかりますか?」は英語で「Since my return flight to my country isn't until late at night, would it be possible for me to stay until 8 PM? If so, would I be charged the same as another night?」になります。
ご参考になれば幸いです。
この場合、次のように聞くと良いでしょう。
ーMy return flight to Japan is late at night. If I stay in my room until 8 p.m., will I have to pay for another night?
「日本の帰国便が夜遅いので、部屋に夜の8時まで滞在したら、もう一泊分払わなければいけませんか?」
My return flight to Japan is late at night. で「日本への帰国便が夜遅い」と言えます。
ご参考まで!