It must be tough working so late at night. Hang in there.
It must be hard putting in the long hours you do. Keep at it.
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーIt must be tough working so late at night. Hang in there.
「夜遅くまで働いてい大変だね。頑張って」
to work so late at night で「夜遅くまで働く」
ーIt must be hard putting in the long hours you do. Keep at it.
「そんなふうに（仕事に）長時間費やして大変だね。頑張って」
to put in the long hours で「長時間費やす」
ご参考まで！
It must be tough working so late.
must be（〜に違いない、〜だよね）を使って、 It must be tough working so late. （そんなに遅くまで働くなんて大変だよね。） と言うのが自然です。tough は「骨が折れる、きつい」という意味で、相手の苦労を理解しているニュアンスがよく伝わります。
カナダ 
アメリカ合衆国 
