本を５０音順に並べて下さいって英語でなんて言うの？

アルファベット順: alphabetical order

時系列順はchronological orderと言います。

Wikipediaによればあいうえお順のことをJapanese alphabetical orderと言えますが、厳密に表す英語はないとのことです。

参考になればm(__)m

Can you put these books in abc order?
(この本を50音順に並べてくださいますか？)
*putの代わりに arrange でも okです！

ABC order(エービーシー オーダー) は 50音順 のことです。

参考にしてください。一つの例として！

おっしゃられている内容は、以下のようにも表現できると思いました(^_^)
Can you put these books in order of aiueo?
「アイウエオの順番に本を並べてもらえますか？」
Can you put these books in order of fifty Japanese syllables?
「日本語の50音順に本を並べてもらえますか？」

以上です。
少しでも参考になれば幸いです(^_^)