そのままの英語ですが、Your eyes are beautiful.で十分通じます。
very beautifulやso beautifulのようにveryやsoを付けて「とても綺麗」と言ってもいいですね。
"stunning", "gorgeous", "captivating" という表現も参考になるでしょう。例えば "Your eyes are stunning."（あなたの目は驚くほど美しい）、"Your eyes are gorgeous."（あなたの目は素晴らしく美しい）、"Your eyes are captivating."（あなたの目は魅力的で目が離せない）などとなります。
ただし、"eye"は単数形で「目」を示し、"eyes"は複数形で「瞳」を指すのが一般的です。人が二つもある目を complimentsする場合は、通常"eyes"と複数形を使用しますので注意してください。
ご参考になれば幸いです。
You have such beautiful eyes.
Your eyes are so beautiful.
上記のように英語で表現することもできます。
いずれも「とても綺麗な瞳だ」という意味の英語表現です。
such や so で強調しています。
お役に立てればうれしいです。
またいつでもご質問ください。
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