（建物たとえば東京スカイツリー）は何メートルですかって英語でなんて言うの？

基本的に「高さ」を訊ねるのであれば、やはり「How tall〜?」で質問します。

その際、測定する単位を「メートルで（in meters）」と指定すれば、ご質問の趣旨にも適うと思います。

How tall~でどれぐらいの高さなのかを聞き、~in metersと最後につけることでメートルでと指定する表現になりますよ！